水頭碼頭位於金門的西南方，負責大小金門的船運，2002年後，隨著兩岸開放小三通，水頭碼頭開始接手小三通服務，興建水頭碼頭旅客服務中心，成為金門目前最繁忙的客運碼頭。

無障礙設施
無障礙廁所、無障礙坡道、無障礙車位